Duża awaryjność silników trakcyjnych, zwłaszcza podczas pracy przy duzych prędkościach była ujemną cechą lokomotyw EU 07. W 1995 roku rozpoczęto więc przebudowę tych lokomotyw, zmieniając przełożenie przekładni głównych, co umożliwiło obniżenie prędkości obrotowej silników o 15%. Jednocześnie nie spowodowało to obniżenia własności trakcyjnych lokomotywy. Ze względu na to, iż pozostawiono łożyskowanie wałów ślizgowych za pomocą łożysk ślizgowych, nie zwiększono prędkości pojazdu. Przebudowane pojazdy zachowały swój numer taborowy.

Lokomotywy przebudowane (84):
303E:  EP07-301, 311, 312, 318, 329, 330, 332, 335, 338, 339, 340, 344, 345, 346, 347, 350, 351, 354, 355, 356, 357, 361, 362, 365, 370, 371, 372, 374, 375, 378, 379, 381, 382, 383, 384, 385, 387, 388, 389, 390, 391, 392, 395, 397, 400, 401, 407, 408, 410, 411, 412, 422, 424, 426, 431, 434, 435, 442, 444, 447, 448, 450, 455, 456, 476, 479, 480, 482, 500, 501, 505, 506, 513, 514, 517, 518, 521, 522, 537, 541, 542, 544
4E:  EP07-107, 129, 135, 154, 174, 183, 185, 187, 198, 201, 211, 229, 233, 242, 243